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En el siguiente cuaderno de código se ejemplifica la obtención de diversas representaciones químicas a través de RDKitypy3Dmol. Utilice este cuadeno de código para resolver los siguientes ejercicios.

Ejercicios de práctica:

  1. Para los siguientes compuestos obtenga los diferentes tipos de representación molecular que se indican.

Representación
Resultado

Representación 2D (Asigne la configuración R o S a los carbonos quirales.)

Representación 3D

SMILES

CCCCN1CCCC[C@H]1C(=O)NC1=C(C)C=CC=C1Cl

SMILES canónicos

SMARTS

InChI

InChiKeys

  1. Encuentra todos los isómeros estructurales del butano (C₄H₁₀) e indique los SMILES de cada isómero. Con color rojo, marque las ramificaciones en los SMILES.

  2. Seleccione 3 estructuras privilegiadas para el diseño de fármacos y complete la siguiente tabla. Dibuje la estructura seleccionada, indique su correspondiente SMARTS y de ejemplos de fármacos o compuestos bioactivos que contengan esa estructura (utilice el código visto en clase para resaltar la estructura privilegiada).

Estructura privilegiada 1
Estructura privilegiada 2
Estructura privilegiada 3

Estructura

Nombre

Espiroacetal [6,6]

SMARTS

Aplicaciones

Antiparasitarios, anticancerígenos

Ejemplo 1

Ejemplo 2

Ejemplo 3

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