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En el siguiente cuaderno de código se ejemplifica la obtención de diversas representaciones químicas a través de RDKitypy3Dmol. Utilice este cuadeno de código para resolver los siguientes ejercicios.
Ejercicios de práctica:
Para los siguientes compuestos obtenga los diferentes tipos de representación molecular que se indican.
Representación 2D (Asigne la configuración R o S a los carbonos quirales.)
Representación 3D
SMILES
CCCCN1CCCC[C@H]1C(=O)NC1=C(C)C=CC=C1Cl
SMILES canónicos
SMARTS
InChI
InChiKeys
Encuentra todos los isómeros estructurales del butano (C₄H₁₀) e indique los SMILES de cada isómero. Con color rojo, marque las ramificaciones en los SMILES.
Seleccione 3 estructuras privilegiadas para el diseño de fármacos y complete la siguiente tabla. Dibuje la estructura seleccionada, indique su correspondiente SMARTS y de ejemplos de fármacos o compuestos bioactivos que contengan esa estructura (utilice el código visto en clase para resaltar la estructura privilegiada).
Estructura
Nombre
Espiroacetal [6,6]
SMARTS
Aplicaciones
Antiparasitarios, anticancerígenos
Ejemplo 1
Ejemplo 2
Ejemplo 3
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