Recursos y ejercicios
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En el siguiente cuaderno de código se ejemplifica la obtención de diversas representaciones químicas a través de RDKitypy3Dmol. Utilice este cuadeno de código para resolver los siguientes ejercicios.
Para los siguientes compuestos obtenga los diferentes tipos de representación molecular que se indican.
Representación 2D (Asigne la configuración R o S a los carbonos quirales.)
Representación 3D
SMILES
CCCCN1CCCC[C@H]1C(=O)NC1=C(C)C=CC=C1Cl
SMILES canónicos
SMARTS
InChI
InChiKeys
Encuentra todos los isómeros estructurales del butano (C₄H₁₀) e indique los SMILES de cada isómero. Con color rojo, marque las ramificaciones en los SMILES.
Seleccione 3 estructuras privilegiadas para el diseño de fármacos y complete la siguiente tabla. Dibuje la estructura seleccionada, indique su correspondiente SMARTS y de ejemplos de fármacos o compuestos bioactivos que contengan esa estructura (utilice el código visto en clase para resaltar la estructura privilegiada).
Estructura
Nombre
Espiroacetal [6,6]
SMARTS
Aplicaciones
Antiparasitarios, anticancerígenos
Ejemplo 1
Ejemplo 2
Ejemplo 3